Die Kirchengemeinde wird 1901 als Tochtergemeinde Schönkirchens gegründet und erlangt am 1. April 1915 ihre Selbständigkeit. Ihren Namen erhält die Gemeinde durch die Kirche, die 1959 eingeweiht wird.

Paul Gerhardt - Die Entscheidung für diesen Namen fällt im Kirchenvorstand, weil die Kirche ursprünglich 1957 fertig gestellt werden sollte. Das Jahr, in dem der 350. Geburtstag Paul Gerhardts begangen wurde.

Die Paul-Gerhardt-Kirche ist die größte evangelische Kirche auf dem Ostufer und die am höchsten gelegene Kirche Kiels. Seit 1983 wird der Altarraum durch ein T-Kreuz des Künstlers Jan Koblasa geschmückt. Es ist das größte Altar-Kreuz in einer Kieler Kirche – sechs Meter lang und ebenso breit aus Eiche mit einem Corpus aus zusammengeleimten Ahornplatten mit einem Gesamtgewicht von 1,5 t.